| Titre et description |
OS |
Type |
Taille |
Nb télé. |
Date |
|---|
Jmol [11.4.4]  Jmol Team
Logiciel gratuit, open-source et multi-plateformes
Jmol est un outil de visualisation de molécules en 3D et animé, il fonctionne en 3D avec tous les navigateurs Web majeurs:
- Internet Explorer (Win32)
- Mozilla/Firefox (Win32, OSX, *nix)
- Safari (Mac OS X)
- Opera 7.5.4 (Win32 seulement)
Formats de fichier
- CIF/mmCIF - standard de l'Union Internationale de Cristallographie
- CML - Chemical Markup Language
- GAMESS - Gordon Research Group, Iowa State University
- Gaussian 94/98/03 - Gaussian, Inc.
- Ghemical
- HIN - HyperChem from Hypercube, Inc.
- Jaguar - Schrodinger, LLC
- MOL/SDF - MDL Information Systems, Inc.
- MOPAC 93/97/2002 - Schrodinger, LLC
- PDB - Protein Data Bank
- Q-Chem - Q-Chem, Inc.
- SHELX
- Spartan - Wavefunction, Inc.
- Ghemical
- NWChem
- XYZ
Les fichiers compressés avec gzip sont automatiquement décompressés
Animations
Vibrations
Support basique de la cellulaire unitaire
Formes schématiques pour les structures secondaires
Mesures
- distance
- angle
- angle de torsion
Support du langage de script RasMol/Chime
Librairie de support JavaScript
Export en JPG, PDF et PovRay.
Attention ! Cette application est réservée à ceux qui connaissent bien le langage Java et son environnement. Une machine Java virtuelle est nécessaire. |
Windows
95/98/NT/2000/XP |
Freeware |
8 Mo |
1879 |
25/05/2008 |
|
Nutrical [1.4.2] Mecocha
Nutrical permet de compter les calories contenues dans les aliments et de calculer ses besoins caloriques.Il est possible de créer et d'archiver facilement des menus équilibrés.
Nutrical calcul le besoins caloriques de chaque utilisateur d'après son activité physique, son âge, son sexe et son poids, en utilisant la méthode de Black et Al.
Nutrical est un logiciel qui permet :
- de compter les calories contenues dans un menu.
- d'ajouter autant d'aliments que vous le souhaitez et de créer de nouvelle catégories.
- de mettre à jour vos aliments par connexion Internet
- de créer des profils nutritionnels personnalisés pour chaque utilisateur. Les besoins caloriques journaliers sont calculés puis pondérés en fonction l'activité physique.
- d'équilibrer les menus (tant que les rations alimentaires ne sont pas trop dépassée) en vous suggérant des aliments contenus dans la base de donnée.
- Nutrical gère les Protéines, les lipides et les glucides. |
Windows
98/2000/XP |
Freeware |
569 Ko |
751 |
07/01/2005 |
Geneious [2.5.4] Biomatters Ltd
Geneious est une suite d'outils pour manipuler, trouver, partager et explorer des données biologiques comme des séquences d'ADN ou de protéines, des phylogenèses, des structures en 3D, des publications.
Il inclut une API (Application Programming Interface) soit une Interface de Programmation d'Applications pour créer vos propres plug-ins.
Exemples d'utilisation :
- Alignement de séquences
- Analyse de séquences
- Analyse phylogénétique et construction d'arbres phylogénétiques
- Accès aux données biologiques
- Visualisation de stucture de protéine
- Organisation de séquences et publications dans une base de donnée
- Téléchargement de séquences de protéines et de gènes
- BLAST, NCBI, EMBL, recherche PubMed
- Etc.
Cette version résout quelques bogues.
Vous pouvez également télécharger des plugins et un manuel en anglais (PDF).
ATTENTION ! Geneious est gratuit pour un usage scolaire. La version professionnelle est payante. Genious inclut une version de démonstration gratuite de Geneious Pro.
   
|
Windows
95/98/NT/2000/XP |
Freeware |
18 Mo |
91 |
15/01/2007 |
CLC Free Workbench (sans Java) [4.0.3] CLC bio
CLC Free Workbench procure un environnement de travail pour des données bio-informatiques. Il dispose de très bonnes options graphiques, d'options d'exportation et d'une gestion de données fluide.
Caractéristiques :
- GenBank : recherche et visualisation
- Création et édition avancé d'alignement et de séquence
- Tables de traduction du code génétique
- Impression facile des rapports et des graphiques
- Importation et exportation de données dans un grand nombre de formats de fichiers
- Log historique détaillé
- Etc.
Exemples :
- Alignements de séquence multiple
Des capacités d'édition et des couleurs variées pour les alignements de séquence multiple. Quand l'alignement est édité et coloré de la façon désiré, il peut-être exporté dans différents formats graphiques et être ainsi utilisé dans des rapports ou des présentations. |  | - Alignements et arbres phylogénétiques
Différentes vues peuvent être ouvertes en même temps. Voici un alignement de séquence multiple et l'arbre phylogénétique correspondant : |  | - Séquence statistiques
Des statistiques sur de multiple séquences peuvent être présentées sous forme comparative. Ainsi il est facile d'obtenir une vue d'ensemble des différences dans un nombre de séquences d'ADN ou de protéines. |  | - Enzymes de restriction
Les enzymes de restriction sont des outils utilisés en laboratoire pour cliver l'ADN. L'analyse des enzymes de restriction peut-être réalisée d'une façon statique ou dynamique. Voici une double séquence ADN isolé clivée par une sélection d'enzymes de restriction. Les enzymes peuvent être activés ou inactivés instantanément à partir du tableau sur le côté qui permet de voir uniquement les enzymes désirés. |  | | - Boîte à outils |  |
Note : cette version inclut Java.
Par ailleurs, d'excellents supports pédagogiques vidéo ou en format PDF (en anglais) sont disponibles sur le site de l'éditeur.
Il existe également chez l'éditeur des versions payantes plus évoluées pour les laboratoires de recherche, les industries ou les professionnels.
Ce logiciel fonctionne également avec Windows Vista. |
Windows
2000/XP |
Shareware |
28 Mo |
41 |
15/09/2007 |
CLC Free Workbench (avec Java) [4.0.3] CLC bio
CLC Free Workbench procure un environnement de travail pour des données bio-informatiques. Il dispose de très bonnes options graphiques, d'options d'exportation et d'une gestion de données fluide.
Caractéristiques :
- GenBank : recherche et visualisation
- Création et édition avancé d'alignement et de séquence
- Tables de traduction du code génétique
- Impression facile des rapports et des graphiques
- Importation et exportation de données dans un grand nombre de formats de fichiers
- Log historique détaillé
- Etc.
Exemples :
- Alignements de séquence multiple
Des capacités d'édition et des couleurs variées pour les alignements de séquence multiple. Quand l'alignement est édité et coloré de la façon désiré, il peut-être exporté dans différents formats graphiques et être ainsi utilisé dans des rapports ou des présentations. | | - Alignements et arbres phylogénétiques
Différentes vues peuvent être ouvertes en même temps. Voici un alignement de séquence multiple et l'arbre phylogénétique correspondant : | | - Séquence statistiques
Des statistiques sur de multiple séquences peuvent être présentées sous forme comparative. Ainsi il est facile d'obtenir une vue d'ensemble des différences dans un nombre de séquences d'ADN ou de protéines. | | - Enzymes de restriction
Les enzymes de restriction sont des outils utilisés en laboratoire pour cliver l'ADN. L'analyse des enzymes de restriction peut-être réalisée d'une façon statique ou dynamique. Voici une double séquence ADN isolé clivée par une sélection d'enzymes de restriction. Les enzymes peuvent être activés ou inactivés instantanément à partir du tableau sur le côté qui permet de voir uniquement les enzymes désirés. | | | - Boîte à outils | |
Note : cette version inclut Java.
Par ailleurs, d'excellents supports pédagogiques vidéo ou en format PDF (en anglais) sont disponibles sur le site de l'éditeur.
Il existe également chez l'éditeur des versions payantes plus évoluées pour les laboratoires de recherche, les industries ou les professionnels.
Ce logiciel fonctionne également avec Windows Vista. |
Windows
2000/XP |
Shareware |
41 Mo |
25 |
15/09/2007 |
Geneious [2.5.4] Biomatters Ltd
Geneious est une suite d'outils pour manipuler, trouver, partager et explorer des données biologiques comme des séquences d'ADN ou de protéines, des phylogenèses, des structures en 3D, des publications.
Il inclut une API (Application Programming Interface) soit une Interface de Programmation d'Applications pour créer vos propres plug-ins.
Exemples d'utilisation :
- Alignement de séquences
- Analyse de séquences
- Analyse phylogénétique et construction d'arbres phylogénétiques
- Accès aux données biologiques
- Visualisation de stucture de protéine
- Organisation de séquences et publications dans une base de donnée
- Téléchargement de séquences de protéines et de gènes
- BLAST, NCBI, EMBL, recherche PubMed
- Etc.
Cette version résout quelques bogues.
Vous pouvez également télécharger des plugins et un manuel en anglais (PDF).
ATTENTION ! Geneious est gratuit pour un usage scolaire. La version professionnelle est payante. Genious inclut une version de démonstration gratuite de Geneious Pro.
|
Mac OS
X |
Freeware |
7 Mo |
24 |
15/01/2007 |
CLC Free Workbench [4.0.3] CLC bio
CLC Free Workbench procure un environnement de travail pour des données bio-informatiques. Il dispose de très bonnes options graphiques, d'options d'exportation et d'une gestion de données fluide.
Caractéristiques :
- GenBank : recherche et visualisation
- Création et édition avancé d'alignement et de séquence
- Tables de traduction du code génétique
- Impression facile des rapports et des graphiques
- Importation et exportation de données dans un grand nombre de formats de fichiers
- Log historique détaillé
- Etc.
Exemples :
- Alignements de séquence multiple
Des capacités d'édition et des couleurs variées pour les alignements de séquence multiple. Quand l'alignement est édité et coloré de la façon désiré, il peut-être exporté dans différents formats graphiques et être ainsi utilisé dans des rapports ou des présentations. | | - Alignements et arbres phylogénétiques
Différentes vues peuvent être ouvertes en même temps. Voici un alignement de séquence multiple et l'arbre phylogénétique correspondant : | | - Séquence statistiques
Des statistiques sur de multiple séquences peuvent être présentées sous forme comparative. Ainsi il est facile d'obtenir une vue d'ensemble des différences dans un nombre de séquences d'ADN ou de protéines. | | - Enzymes de restriction
Les enzymes de restriction sont des outils utilisés en laboratoire pour cliver l'ADN. L'analyse des enzymes de restriction peut-être réalisée d'une façon statique ou dynamique. Voici une double séquence ADN isolé clivée par une sélection d'enzymes de restriction. Les enzymes peuvent être activés ou inactivés instantanément à partir du tableau sur le côté qui permet de voir uniquement les enzymes désirés. | | | - Boîte à outils | |
Note : cette version inclut Java.
Par ailleurs, d'excellents supports pédagogiques vidéo ou en format PDF (en anglais) sont disponibles sur le site de l'éditeur.
Il existe également chez l'éditeur des versions payantes plus évoluées pour les laboratoires de recherche, les industries ou les professionnels. |
Mac OS
X |
Shareware |
27 Mo |
20 |
15/09/2007 |
Geneious [2.5.4] Biomatters Ltd
Geneious est une suite d'outils pour manipuler, trouver, partager et explorer des données biologiques comme des séquences d'ADN ou de protéines, des phylogenèses, des structures en 3D, des publications.
Il inclut une API (Application Programming Interface) soit une Interface de Programmation d'Applications pour créer vos propres plug-ins.
Exemples d'utilisation :
- Alignement de séquences
- Analyse de séquences
- Analyse phylogénétique et construction d'arbres phylogénétiques
- Accès aux données biologiques
- Visualisation de stucture de protéine
- Organisation de séquences et publications dans une base de donnée
- Téléchargement de séquences de protéines et de gènes
- BLAST, NCBI, EMBL, recherche PubMed
- Etc.
Cette version résout quelques bogues.
Vous pouvez également télécharger des plugins et un manuel en anglais (PDF).
ATTENTION ! Geneious est gratuit pour un usage scolaire. La version professionnelle est payante. Genious inclut une version de démonstration gratuite de Geneious Pro.
|
Linux
|
Freeware |
23 Mo |
18 |
15/01/2007 |
CLC Protein Workbench [4.0] CLC Bio
CLC Protein Workbench crée un environnement logiciel permettant aux utilisateurs de réaliser un grand nombre d'analyses de séquences de protéïnes avancées, combinées avec une gestion des données lissées, une excellente vue graphique et des options de sortie.
CLC Protein Workbench permet d'accéder à un grand nombre d'outils de recherche intégrés :
- Vue moléculaire en 3D intégrée
- Prédiction de l'hélice transmenbranaire
- Prédictions d'une structure secondaire de protéine
- Identification du signal des peptides et de leurs sites de segmentation
- Partage de données parmi les chercheurs
- Toutes les actions accomplies sont automatiquement mis dans un log pour être imprimées ou visualisées plus tard
- Etc.
Cette version d'évaluation offre une période d'essai de 30 jours.
|
Windows
2000/Vista/XP |
Shareware |
59 Mo |
15 |
27/06/2008 |
CLC Free Workbench (sans Java) [4.0.3] CLC bio
CLC Free Workbench procure un environnement de travail pour des données bio-informatiques. Il dispose de très bonnes options graphiques, d'options d'exportation et d'une gestion de données fluide.
Caractéristiques :
- GenBank : recherche et visualisation
- Création et édition avancé d'alignement et de séquence
- Tables de traduction du code génétique
- Impression facile des rapports et des graphiques
- Importation et exportation de données dans un grand nombre de formats de fichiers
- Log historique détaillé
- Etc.
Exemples :
- Alignements de séquence multiple
Des capacités d'édition et des couleurs variées pour les alignements de séquence multiple. Quand l'alignement est édité et coloré de la façon désiré, il peut-être exporté dans différents formats graphiques et être ainsi utilisé dans des rapports ou des présentations. | | - Alignements et arbres phylogénétiques
Différentes vues peuvent être ouvertes en même temps. Voici un alignement de séquence multiple et l'arbre phylogénétique correspondant : | | - Séquence statistiques
Des statistiques sur de multiple séquences peuvent être présentées sous forme comparative. Ainsi il est facile d'obtenir une vue d'ensemble des différences dans un nombre de séquences d'ADN ou de protéines. | | - Enzymes de restriction
Les enzymes de restriction sont des outils utilisés en laboratoire pour cliver l'ADN. L'analyse des enzymes de restriction peut-être réalisée d'une façon statique ou dynamique. Voici une double séquence ADN isolé clivée par une sélection d'enzymes de restriction. Les enzymes peuvent être activés ou inactivés instantanément à partir du tableau sur le côté qui permet de voir uniquement les enzymes désirés. | | | - Boîte à outils | |
Note : cette version inclut Java.
Par ailleurs, d'excellents supports pédagogiques vidéo ou en format PDF (en anglais) sont disponibles sur le site de l'éditeur.
Il existe également chez l'éditeur des versions payantes plus évoluées pour les laboratoires de recherche, les industries ou les professionnels. |
Linux
|
Shareware |
28 Mo |
13 |
15/09/2007 |
CLC Free Workbench (avec Java) [4.0.3] CLC bio
CLC Free Workbench procure un environnement de travail pour des données bio-informatiques. Il dispose de très bonnes options graphiques, d'options d'exportation et d'une gestion de données fluide.
Caractéristiques :
- GenBank : recherche et visualisation
- Création et édition avancé d'alignement et de séquence
- Tables de traduction du code génétique
- Impression facile des rapports et des graphiques
- Importation et exportation de données dans un grand nombre de formats de fichiers
- Log historique détaillé
- Etc.
Exemples :
- Alignements de séquence multiple
Des capacités d'édition et des couleurs variées pour les alignements de séquence multiple. Quand l'alignement est édité et coloré de la façon désiré, il peut-être exporté dans différents formats graphiques et être ainsi utilisé dans des rapports ou des présentations. | | - Alignements et arbres phylogénétiques
Différentes vues peuvent être ouvertes en même temps. Voici un alignement de séquence multiple et l'arbre phylogénétique correspondant : | | - Séquence statistiques
Des statistiques sur de multiple séquences peuvent être présentées sous forme comparative. Ainsi il est facile d'obtenir une vue d'ensemble des différences dans un nombre de séquences d'ADN ou de protéines. | | - Enzymes de restriction
Les enzymes de restriction sont des outils utilisés en laboratoire pour cliver l'ADN. L'analyse des enzymes de restriction peut-être réalisée d'une façon statique ou dynamique. Voici une double séquence ADN isolé clivée par une sélection d'enzymes de restriction. Les enzymes peuvent être activés ou inactivés instantanément à partir du tableau sur le côté qui permet de voir uniquement les enzymes désirés. | | | - Boîte à outils | |
Note : cette version inclut Java.
Par ailleurs, d'excellents supports pédagogiques vidéo ou en format PDF (en anglais) sont disponibles sur le site de l'éditeur.
Il existe également chez l'éditeur des versions payantes plus évoluées pour les laboratoires de recherche, les industries ou les professionnels. |
Linux
|
Shareware |
46 Mo |
10 |
15/09/2007 |
CLC Protein Workbench (sans Java) [3.6.2] CLC Bio
CLC Protein Workbench crée un environnement logiciel permettant aux utilisateurs de réaliser un grand nombre d'analyses de séquences de protéïnes avancées, combinées avec une gestion des données lissées, une excellente vue graphique et des options de sortie.
CLC Protein Workbench permet d'accéder à un grand nombre d'outils de recherche intégrés :
- Vue moléculaire en 3D intégrée
- Prédiction de l'hélice transmenbranaire
- Prédictions d'une structure secondaire de protéine
- Identification du signal des peptides et de leurs sites de segmentation
- Partage de données parmi les chercheurs
- Toutes les actions accomplies sont automatiquement mis dans un log pour être imprimées ou visualisées plus tard
- Etc.
Cette version d'évaluation offre une période d'essai de 30 jours.
|
Windows
2000/Vista/XP |
Shareware |
45 Mo |
6 |
15/04/2008 |
CLC Protein Workbench (64 bits) [4.0] CLC Bio
CLC Protein Workbench crée un environnement logiciel permettant aux utilisateurs de réaliser un grand nombre d'analyses de séquences de protéïnes avancées, combinées avec une gestion des données lissées, une excellente vue graphique et des options de sortie.
CLC Protein Workbench permet d'accéder à un grand nombre d'outils de recherche intégrés :
- Vue moléculaire en 3D intégrée
- Prédiction de l'hélice transmenbranaire
- Prédictions d'une structure secondaire de protéine
- Identification du signal des peptides et de leurs sites de segmentation
- Partage de données parmi les chercheurs
- Toutes les actions accomplies sont automatiquement mis dans un log pour être imprimées ou visualisées plus tard
- Etc.
Cette version d'évaluation offre une période d'essai de 30 jours.
|
Windows
2000/Vista/XP |
Shareware |
69 Mo |
2 |
27/06/2008 |
CLC Protein Workbench [4.0] CLC Bio
CLC Protein Workbench crée un environnement logiciel permettant aux utilisateurs de réaliser un grand nombre d'analyses de séquences de protéïnes avancées, combinées avec une gestion des données lissées, une excellente vue graphique et des options de sortie.
CLC Protein Workbench permet d'accéder à un grand nombre d'outils de recherche intégrés :
- Vue moléculaire en 3D intégrée
- Prédiction de l'hélice transmenbranaire
- Prédictions d'une structure secondaire de protéine
- Identification du signal des peptides et de leurs sites de segmentation
- Partage de données parmi les chercheurs
- Toutes les actions accomplies sont automatiquement mis dans un log pour être imprimées ou visualisées plus tard
- Etc.
Cette version d'évaluation offre une période d'essai de 30 jours.
|
Mac OS
X |
Shareware |
48 Mo |
1 |
27/06/2008 |
CLC Protein Workbench [3.6.2] CLC Bio
CLC Protein Workbench crée un environnement logiciel permettant aux utilisateurs de réaliser un grand nombre d'analyses de séquences de protéïnes avancées, combinées avec une gestion des données lissées, une excellente vue graphique et des options de sortie.
CLC Protein Workbench permet d'accéder à un grand nombre d'outils de recherche intégrés :
- Vue moléculaire en 3D intégrée
- Prédiction de l'hélice transmenbranaire
- Prédictions d'une structure secondaire de protéine
- Identification du signal des peptides et de leurs sites de segmentation
- Partage de données parmi les chercheurs
- Toutes les actions accomplies sont automatiquement mis dans un log pour être imprimées ou visualisées plus tard
- Etc.
Cette version d'évaluation offre une période d'essai de 30 jours.
|
Mac OS
X |
Shareware |
46 Mo |
0 |
15/04/2008 | |
